La phase 2 de Perspectives STS, amorcée à l’automne 2005, vise à ce que l’effort scientifique et technologique du Québec puisse aider véritablement les acteurs de la société québécoise à relever les défis. Ainsi, des stratégies de recherche à long terme seront mises en oeuvre pour chacun d’entre eux. Ces stratégies détermineront les thèmes de recherche à développer en priorité et les moyens nécessaires pour mener à bien ces travaux. Elles indiqueront également comment transférer les connaissances vers les milieux de pratique et les diffuser à la population.
Il est prévu de former sept comités de pilotage composés de chercheurs et d’utilisateurs pour concevoir ces stratégies.